Čokolada se najbolje čuva na temperaturi između 15 i 18°C, u suhom prostoru zaštićenom od izravne sunčeve svjetlosti. Velike temperaturne oscilacije mogu uzrokovati pojavu bjelkastih mrlja na površini (tzv. masni ili šećerni cvat) — to je bezopasno, ali utječe na izgled i djelomično na teksturu.
Izbjegavajte čuvanje čokolade u hladnjaku, osim u vrlo toplim ljetnim mjesecima, jer vlaga iz hladnjaka može oštetiti površinu i ubrzati upijanje mirisa drugih namirnica. Ako je čuvanje u hladnjaku nužno, čokoladu stavite u nepropusnu vrećicu ili kutiju.
Nakon otvaranja ambalaže, čokoladu je najbolje dobro zamotati u originalno pakiranje ili aluminijsku foliju te je potrošiti u razumnom roku radi najboljeg okusa. Praline i tartufi s kremastim punjenjem imaju kraći rok trajanja nakon otvaranja i preporučuje se čuvanje na hladnijem mjestu.